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            論文編號 202105-192
            論文題目 棉花苗期耐鹽相關基因GhISR94的克隆及生物信息學分析
            文獻類型
            收錄
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            棉花苗期耐鹽相關基因GhISR94的克隆及生物信息學分析

            首發時間:2021-05-26

            魏警坤 1   

            魏警坤(1996-),女,在讀碩士

            李志坤 1   

            李志坤(1979-),女,教授,碩導,主要從事棉花抗逆育種研究

            • 1、河北農業大學/省部共建華北作物改良與調控國家重點實驗室,河北保定,071001

            摘要:苗期是棉花響應鹽脅迫反應最關鍵的時期之一,篩選出苗期耐鹽相關候選基因、解析耐鹽機制對培育耐鹽品種、發展鹽堿地植棉具有重要意義。本研究在前期鹽脅迫下六個陸地棉品種蛋白質組測序的基礎上,篩選并克隆了一個只在特異應答階段差異表達的苗期耐鹽相關基因GhISR94,該基因位于D亞組05號染色體,其開放閱讀框包含1404bp,編碼467個氨基酸?;蚪Y構分析顯示其無內含子,GhISR94蛋白無跨膜結構,有信號肽的概率為18.914%。保守域分析結果顯示,GhISR94編碼蛋白包含一個Glycosyltransferase domain,屬于UDP糖基轉移酶蛋白。

            關鍵詞: 陸地棉 苗期 基因克隆 生物信息學分析 UDP糖基轉移酶

            For information in English, please click here

            Cloning and Bioinformatics Analysis of Salt-tolerant Related Gene GhISR94 in Cotton Seedling

            WEI Jingkun 1   

            魏警坤(1996-),女,在讀碩士

            LI Zhikun 1   

            李志坤(1979-),女,教授,碩導,主要從事棉花抗逆育種研究

            • 1、Hebei Agricultural University/State Key Laboratory of North China Crop Improvement and Regulation, Hebei Baoding, 071001

            Abstract:Seedling stage is one of the most critical periods for cotton to respond to salt stress. It is vital to screen genes that related to salt tolerance at seedling stage and to analyze the mechanism of salt tolerance for the breeding salt-tolerant varieties and the development of cotton planting in saline-alkali land. Based on the proteome sequencing of six upland cotton varieties under salt stress in our previously study, we screened and cloned a salt-tolerant gene GHISR94 at seedling stage, which was differentially expressed only in the specific response stage. This gene was located on chromosome 05 of the D-subgenome, and the open reading frame was 1404bp, encoded 467 amino acids. Gene structure analysis showed it had not intron. GhISR94 protein had no transmembrane structure, and the probability of signal peptide was 18.914%. The conserved domain analysis showed that GhISR94 contained a Glycosyltransferase domain, which belonged to UDP Glycosyltransferase protein.

            Keywords: Upland cotton Seedling stage Gene cloning Bioinformatics analysis, UDP Glycosyltransferase

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            導出參考文獻

            .txt .ris .doc
            魏警坤,李志坤. 棉花苗期耐鹽相關基因GhISR94的克隆及生物信息學分析[EB/OL]. 北京:中國科技論文在線 [2021-05-26]. http://www.c1gkrice.com/releasepaper/content/202105-192.

            No.****

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